01. Introduction

By Yan Li,

PhD in Bioinformatics, University of Liverpool

What is Bioinformatics?

  • Genome sequencing
  • Omics
  • Big data
  • Interdisciplinary

Genome sequencing

Omics

Big data



213,865,349

Genomes in NCBI database (until Aug 2019)

Interdisciplinary

大部分生物信息学工作者都是生物学背景，甚至物理，化学出生的。 因为学计算机和统计挺赚钱的，不需要转生物信息学。

Application

  • 23andme, wegene
  • Infective diseases control
  • Cancer Companion Diagnostics
  • Gut metagenomic
  • Protein structure prediction

About this course

  • All the slides will be in English
  • Based on open-source softwares and resources
  • Will help you master the follow skills:
    1. Basic Linux usage and Bash programming
    2. Use Bioinformatic tools and Databases
    3. Basic R and statistics

挑选一篇paper 使用英语的目的是：1,第一次见到计算机和生物的专业名词都是英语的形式，2.习惯英语阅读，查资料时可以查阅一手的，准确的英语资料，而不是二手的，过时的，不准确的翻译中文资料，3，我的资料来源主要是英语，所以做成英文ppt对我来说容易一些

Reading

能用计算器就能用R